Nogle databasers primære datakilde er Landspatientregistret (LPR) og/eller andre centrale registre f.eks. Patologiregister. Det fremgår af databasens dokumentation, hvordan population afgrænses og hvilke oplysninger fra LPR-indberetningen, som benyttes i databasens opgørelser.
Når klinisk personale udfører undersøgelse og behandling på offentlige og private sygehuse i Danmark registreres der oplysninger om aktiviteten i det lokale journalsystem. En del af disse oplysninger er indberetningspligtige til LPR, som forvaltes af Sundhedsdatastyrelsen. Indberetningspligtige oplysninger fremgår af indberetningsvejledningen.